Gli uccelli si difendono in molti modi, tra cui la raccolta in grandi gruppi o greggi. In un gruppo, tutti gli uccelli tengono d'occhio i predatori e qualsiasi uccello che individua un potenziale pericolo emette un allarme. I singoli uccelli che cercano il cibo segnalano anche il gregge quando trovano una buona fonte di cibo.
Per proteggersi dal freddo, molti uccelli consumano grandi quantità di cibo. Tuttavia, mangiare li mette in una posizione stazionaria in cui sono vulnerabili ai predatori, quindi scansionano spesso il loro ambiente mentre mangiano. Durante i mesi invernali, gli uccelli regolano istintivamente il loro apporto per mantenere una massa corporea che li protegga dal freddo, consentendo comunque loro di fuggire rapidamente quando compare il pericolo.
Un altro modo in cui gli uccelli si proteggono è quello di riempire le loro piume per stare al caldo. Uccelli dell'ordine I passeriformi, che costituiscono oltre la metà di tutte le specie di uccelli, hanno i cappotti lanuginosi che intrappolano il calore del corpo, mentre le loro piume esterne li proteggono dal vento e dal freddo. In alternativa, alcuni uccelli, tra cui calanchi e cinciallegre, abbassano la temperatura corporea in risposta al freddo estremo, entrando in uno stato di ibernazione controllata quando le temperature si abbassano durante la notte.
Gli uccelli cercano rifugio anche per nascondersi dai predatori e proteggersi dagli elementi. Si appostano nei buchi degli alberi sugli alberi o sui cornicioni, e persino scavano nella neve, spesso scegliendo nascondigli che si abbinano alla loro colorazione come una forma di mimetizzazione. Inoltre, gli uccelli canori sembrano proteggere e difendere il loro territorio e i terreni di cacciatori di uccelli cantando, nonostante il fatto che fare rumore li lasci vulnerabili agli attacchi.