Internamente, le piante sono dotate di sistemi immunitari per difendersi dagli agenti patogeni e molte producono sostanze chimiche per tenere lontani gli attacchi di potenziali predatori, come scarafaggi, vermi e altri insetti. Alcune piante hanno anche cardi appuntiti e aghi lungo i loro steli e rami per renderli sgradevoli (e immangiabili) alla preda, mentre altri spuntano fiori colorati che sono certamente piacevoli alla vista, ma soprattutto, avvertire i predatori che le piante hanno veleno o sostanze chimiche tossiche all'interno.
Come gli esseri umani, le piante hanno sistemi immunitari che li proteggono dagli attacchi degli agenti patogeni. Proprio come gli ormoni e le sostanze chimiche difendono le persone da virus, batteri e altre malattie, il sistema immunitario delle piante contiene sostanze chimiche e sostanze nutritive che combattono gli attacchi di malattie e parassiti. Molte piante producono le sostanze chimiche di cui hanno bisogno per costruire i loro sistemi di difesa durante le prime fasi della vita, mentre altre iniziano a produrre quegli agenti in seguito a incontri con agenti patogeni stranieri.
Oltre al loro sistema immunitario attivo, le piante secernono sostanze chimiche speciali, che sono spesso inodore e invisibili all'occhio umano ma possono essere viste e odorate da lontano da uccelli, insetti e insetti. Alcune piante, invece di tenere a bada i predatori, producono sostanze dolci e sciroppose che attirano afidi, vermi e altri organismi; questi sciroppi sono consumati da quegli organismi e contengono tossine che alla fine li uccidono.
