Esiste una proteina marcatore nella membrana cellulare e serve da identificatore della cellula. La proteina analizza ogni invasore, si lega a loro e induce una risposta visiva a prendere la sua decisione.
Il sistema immunitario di un corpo utilizza proteine marcatore per distinguere le cellule amiche dagli invasori stranieri. Le proteine marcatore sono tutti identificatori univoci, così simili alle impronte digitali umane, non esistono due uguali.
Queste proteine svolgono un ruolo importante in cose come il trapianto di organi umani. Se le proteine marcatori sull'organo trapiantato sono diverse da quelle dell'organo originale, il corpo la respingerà come un invasore straniero.