Secondo Discover Magazine, il perossido di idrogeno si trova naturalmente nella tiroide, nell'intestino e nei polmoni umani. Science Daily afferma che il composto è prodotto dall'organismo per mantenere le sue cellule sane.
Gli scienziati hanno scoperto che quando il sistema immunitario viene attivato, il perossido di idrogeno arriva al sito dell'infezione molto prima dei globuli bianchi. Discover Magazine afferma che il perossido di idrogeno ha un certo ruolo nel chiamare i globuli bianchi in una zona danneggiata. Inoltre, si ipotizza che l'aumento della produzione di perossido di idrogeno possa avere a che fare con malattie caratterizzate da alti livelli di globuli bianchi.