Le cellule di batteri hanno organelli, anche se generalmente sono meno numerosi e meno complicati di quelli trovati in piante e animali. Più comunemente, i batteri contengono ribosomi. Questi organelli sono composti da granuli ricchi di RNA situati all'interno del citoplasma e sono il sito per la sintesi proteica.
Le cellule di batteri sono composte in modo diverso rispetto a quelle di piante e animali. Mancano un nucleo e la maggior parte degli altri organelli legati alla membrana, ad eccezione dei ribosomi. La cellula batterica ha un corpo basale che gli consente di ruotare, e la maggior parte ha una membrana all'esterno della parete cellulare. Le cellule batteriche contengono DNA situato nel citoplasma.
Altri organelli possono includere flagello e pili. Il flagello del batterio viene utilizzato per il movimento. Pili consente ai batteri di trasferire DNA e attaccarsi alle superfici.