I segregazionisti volevano mettere sotto accusa Earl Warren perché, attraverso la sua leadership nella Corte Suprema degli Stati Uniti, la segregazione delle scuole pubbliche era stata giudicata incostituzionale con una decisione unanime. Ciò ha spinto la legislazione a vietare la segregazione anche in altre aree.
Il primo caso che Warren considerò giustizia della Corte Suprema fu Brown v. Board of Education nel 1954. Rimanendo in attesa del suo mandato fino alla sua nomina fu confermato dal Senato, Warren incoraggiò i giudici a trovare un terreno comune sulla questione. Alla fine, li persuase a raggiungere un consenso sostenendo che l'unico modo per mantenere la segregazione era credere nell'inferiorità intrinseca dei neri, e solo l'unanimità della Corte Suprema avrebbe superato la forte resistenza alla desegregazione negli stati meridionali. I segregazionisti che si opposero alla sentenza iniziarono il movimento "Impeach Earl Warren" perché lo giustamente percepirono come la forza decisiva dietro l'unione della corte nella decisione.
La decisione di Brown v. Board of Education ha esacerbato le turbolenze sui diritti civili negli anni '50 e '60. Tuttavia, ha anche ispirato altre leggi sui diritti civili come il Civil Rights Act del 1964, che ha messo fuorilegge le discriminazioni e garantito a tutti i cittadini pari protezione e il Voting Rights Act del 1965, che vietava la discriminazione degli elettori.