Le barriere coralline sono in pericolo a causa dell'aumento delle temperature globali, dell'inquinamento e della pesca eccessiva. Si stima che circa 1/5 di tutte le barriere coralline del pianeta siano state distrutte. I restanti potrebbero potenzialmente svanire entro il 2050.
Il riscaldamento globale è un problema per le barriere coralline che nel 2005 si stima che il 50 per cento delle barriere coralline in Florida e quasi il 90 per cento di quelle delle Isole Vergini statunitensi sia morto dopo aver sofferto per settimane di temperature elevate dell'acqua. L'innalzamento delle temperature rende l'acqua acida per la barriera corallina, causando la barriera più suscettibile a malattie e danni.
L'inquinamento può causare danni al reef e soffocare. La spazzatura e i sedimenti causati dall'inquinamento umano possono accumularsi attorno alla barriera, impedendole di ottenere i nutrienti di cui ha bisogno per sopravvivere. Le cose semplici, come la lenza usata nell'acqua, possono aggrovigliarsi nella barriera corallina causando lesioni e morte al corallo.
Per combattere questi problemi, la Coral Restoration Foundation sta lavorando per ricostruire le barriere coralline danneggiate o distrutte. La fondazione ha vivai sottomarini in cui il corallo giovane viene lasciato maturare per almeno un anno prima di essere trapiantato sulle barriere coralline esistenti.