Il pH nell'intestino tenue aumenta da pH 6 nel duodeno a pH 7,4 all'estremità distale dell'intestino tenue nell'ileo terminale. Il pH diminuisce fino a pH 5,7 nel cieco ma aumenta a pH 6,7 nel retto.
La parte più acida del tratto gastrointestinale umano è lo stomaco, che è generalmente intorno a pH 1 a pH 3. L'elevata acidità nello stomaco combatte i batteri che vengono ingeriti con il cibo. Man mano che la distanza aumenta dallo stomaco, il livello di pH aumenta gradualmente. L'intestino crasso è pH 5,5 a pH 7.
