Il sistema escretore rimuove le sostanze potenzialmente tossiche che si accumulano dai processi metabolici. Nei mammiferi, gli organi primari utilizzati per filtrare il sangue di sostanze chimiche in eccesso, in particolare i rifiuti azotati, sono i reni. Altri organi coinvolti includono gli ureteri che trasportano l'urina alla vescica, che immagazzina i rifiuti fino a quando non possono essere espulsi attraverso l'uretra.
Nei mammiferi, l'urina viene utilizzata per raccogliere rifiuti azotati sotto forma di acido urico o, come negli umani, di urea. L'urea è una sostanza chimica solubile in acqua, quindi il corpo può facilmente utilizzare l'acqua in eccesso per liberarsi di esso. L'acido urico, d'altra parte, non è idrosolubile ed è escreto come solido da specie come gli uccelli con pochissima acqua. Questo è anche usato da molte specie nei climi aridi dove usare l'acqua per l'escrezione sarebbe troppo dispendioso.
Grandi quantità di acqua e sostanze chimiche sono assorbite dai reni, ma una grande maggioranza viene restituita al sangue. I reni sono almeno necessari per regolare l'equilibrio dei liquidi nel corpo così come lo sono per l'eliminazione dei rifiuti. Altri organi coinvolti nel sistema escretore includono il fegato e la pelle, che rimuove alcuni materiali tossici e di rifiuto attraverso la sudorazione.
