Secondo il Museo di Paleontologia dell'Università della California, le principali differenze morfologiche tra monocot e fiori dicotomici includono il numero di cotiledoni, la struttura pollinica, il numero di parti di fiori, le vene fogliari, la disposizione vascolare del gambo, lo sviluppo delle radici e la crescita secondaria. La base effettiva per differenziare le due classi di angiosperme è il numero di cotiledoni nell'embrione.
I cotiledoni assorbono i nutrienti dal seme fino a quando la semina non è in grado di produrre le prime foglie vere e iniziare la fotosintesi. La maggior parte dei dicotiledoni discendono da una pianta che ha sviluppato tre solchi o pori nel suo polline, noto come triporato. D'altra parte, le monocotiledoni hanno un polline con un singolo solco o poro attraverso lo strato esterno, noto come monosulcato. Il numero di parti di fiori monocot è tipicamente divisibile per tre, mentre i fiori di dicot hanno parti in multipli di quattro o cinque.
Il Museo di Paleontologia della University of California sottolinea che un certo numero di vene principali delle foglie corrono parallele lungo la lunghezza della foglia in monocotiledoni. I dicotiledoni hanno fasci vascolari che sono disposti all'interno del gambo per formare un cilindro e appaiono come un anello di macchie quando il fiore viene tagliato attraverso il gambo. Le monocotiledoni hanno fasci vascolari che sembrano sparsi attraverso lo stelo.
