I funghi sono eterotrofi, il che significa che soddisfano i loro bisogni di carbonio ed energia abbattendo e assimilando la materia organica. I funghi sono in grado di assorbire e metabolizzare un'ampia varietà di carboidrati, tra cui glucosio, xilosio e fruttosio. I carboidrati più difficili sono anche facilmente digeribili, come la cellulosa e l'emicellulosa.
I funghi usano gli enzimi per abbattere i materiali su cui crescono. Quando si assorbe il materiale digerito, il cibo deve essere sotto forma di soluzione per entrare nelle pareti ifali dei funghi. I funghi e i batteri saprobici sono in gran parte responsabili della maggior parte della decomposizione organica. In generale, i funghi richiedono ossigeno per sopravvivere, ma sono anche in grado di utilizzare la fermentazione quando mancano di ossigeno.
