La vegetazione della Malesia è costituita principalmente da foresta pluviale di pianura, foresta submontana e montana e foresta paludosa, di marea, d'acqua dolce e torbiera. Ci sono anche foreste erbacee nei terreni lisciviati e sabbiosi e sulla costa.
La Malesia si trova sull'equatore e riceve una grande quantità di pioggia. Di conseguenza, le temperature sono alte tutto l'anno, rendendo l'ambiente ideale per la vita vegetale esuberante. La varietà di piante in Malesia è tra le più alte al mondo.
Le specie di piante vascolari sono migliaia, con le specie arboree che ne contano più di 2.000. Alcune delle piante più spettacolari esistono in Malesia. Tra loro c'è il più grande fiore conosciuto, il mostro parassita che misura quasi un metro di diametro. La Malesia è anche sede di molti tipi di piante carnivore di brocca.
In meno della metà di un acro, è possibile trovare cento diverse specie di alberi, arbusti, piante rampicanti ed epifite, piante non parassite che crescono su altre piante e si nutrono fuori dall'atmosfera.
Gran parte della giungla è stata distrutta da radure agricole o commerciali, forti venti e tempeste di fulmini e da popolazioni indigene che hanno ripulito la terra per spostare la coltivazione. Quando la terra bonificata viene abbandonata, la macchia, i prati grossolani e le foreste secondarie reclamano la terra.
