Le cellule eucariotiche sono tutte dotate di un nucleo e i loro organelli sono racchiusi all'interno delle membrane. Hanno anche una membrana plasmatica, che è uno strato di fosfolipidi che circonda l'intera cellula e presentano un citoscheletro interno .
In confronto alle cellule procariotiche, le cellule eucariotiche sono almeno 10 volte più grandi. Il loro citoplasma è composto da entrambi i ribosomi e cistolo. Protetti dalla loro membrana plasmatica, hanno anche protezioni per ogni organello sotto forma di singole membrane. La membrana plasmatica è il sito per le funzioni di segnalazione e trasporto per l'intera cellula.
All'interno delle cellule eucariotiche, il sistema endomembrane è una rete di membrane che condividono materiali. I lisosomi, il reticolo endoplasmatico e l'apparato di Golgi fanno tutti parte di questo più ampio sistema. Le cellule eucariotiche hanno anche una matrice extracellulare composta da glicoproteine e proteine che altre cellule hanno secreto. Questa matrice si trova attorno a molte diverse cellule animali.
Le cellule eucariotiche si spostano per la funzione di flagelli o ciglia, a seconda del tipo di eucariota. I flagelli sono code ad un'estremità della cellula che si muovono avanti e indietro, spingendo la cellula in una direzione. Le cilia sono più corte e numerose e battono tutti insieme per guidare la cellula in una direzione particolare.