Quando si utilizza la cromatografia su carta, la solubilità dei pigmenti, l'attrattiva della carta e la dimensione delle particelle influenzano la separazione dei pigmenti. Il processo della cromatografia funziona per separare le miscele di sostanze nel loro componenti.
La cromatografia su carta è un metodo comune e si propone di separare i diversi pigmenti che costituiscono uno specifico inchiostro o colorante. La carta per cromatografia è sempre di colore bianco puro in modo da non contaminare i campioni di inchiostro. I solventi si fanno strada sulla carta e i diversi pigmenti dell'inchiostro o della tintura viaggiano a velocità diverse. Una volta completato il processo, ci saranno dei punti di inchiostro sulla carta che mostrano i diversi colori che compongono l'inchiostro.