Cilia, flagelli e pseudopodi condividono tutti uno scopo comune nell'aiutare le singole cellule a spostarsi da un luogo all'altro. Cilia e flagelli sono entrambe strutture permanenti utilizzate per nuotare nell'acqua, mentre gli pseudopodi sono estensioni temporanee della cellula utilizzata allungare la mano per trascinare la cella lungo.
Le cilia si trovano in cellule con nuclei, di solito con diverse di esse in due tipi diversi in ogni cellula. Le ciglia sono costruite con speciali strutture proteiche chiamate microtubuli circondate dalla membrana cellulare. Questi microtubuli sono un elemento del citoscheletro, un gruppo di proteine che danno alla struttura cellulare. Ciglia multiple relativamente corte allineano le celle e battono come remi per spostare la cella lungo.
Le flagelle sono lunghe code a forma di frusta, e in genere ogni cellula ne ha solo una. Sono lunghi rispetto alle cilia. Si trovano in entrambe le celle con nuclei e quelli senza, ma i due tipi sono diversi. Le ciglia di cellule con nuclei sono, come le ciglia, composte da microtubuli circondati dalla membrana cellulare. Si muovono avanti e indietro per spingere le celle. Quelle di cellule prive di nuclei sono strutture proteiche uniche che ruotano effettivamente come una lunga elica per spingere le cellule lungo.
Gli pseudopodi si trovano solo nelle cellule con nuclei. Queste strutture sono formate sia per la locomozione che per catturare il cibo.