Un codone è una serie di tre nucleotidi utilizzati per specificare uno specifico amminoacido. Questi nucleotidi sono etichettati con G, C e A e si trovano sia nell'RNA che nel DNA. I codoni contenenti T si trovano solo nel DNA e nei codoni contenenti U solo nell'RNA.
I nucleotidi trovati nei codoni determinano quale scopo ha quel codone nella sequenza del DNA o dell'RNA. Ogni codone indica quale aminoacido è stato creato per una data proteina, seguendo una sequenza di codoni che funzionano in questo modo. I codoni sono essenzialmente le istruzioni per le cellule per creare le proteine necessarie per creare la vita, formando le basi della comunicazione cellulare.
I cinque nucleotidi trovati tra RNA e DNA sono adenina, citosina, guanina, timina e uracile con ciascun rispettivo nucleotide rappresentato nel codice dalla prima lettera della parola. Esiste un nucleotide non standard, chiamato inosina, che si lega con adenina, citosina o timina in una determinata sequenza. Questi nucleotidi si legano con altre molecole organiche per creare i composti biologici di cui ogni cellula ha bisogno.
I codoni di avvio e arresto nell'RNA - i codoni che indicano all'inizio e alla fine della sequenza - sono AUG per l'avvio e UAA, UGA e UAG per l'arresto. Senza questi codoni, sarebbe impossibile per le cellule dire dove o come dovrebbe essere usata la sequenza.