Alcuni esempi di batteri aerobici includono Mycobacterium tuberculosis, che causa la tubercolosi, i batteri del genere Nocardia, che causano la nocardiosi e Psuedomonas aeruginosa, che causa la polmonite, infezioni del tratto urinario e problemi gastrointestinali. Wholly aerobic i batteri hanno metabolismo a base di ossigeno e non possono sopravvivere senza ossigeno.
I batteri anaerobici non richiedono ossigeno. Le differenze tra batteri anaerobici e aerobi possono essere viste quando sono posizionate in un mezzo di coltura. I batteri aerobici si raccolgono sulla superficie del mezzo liquido in modo da essere esposti alla quantità massima di ossigeno. Alcuni batteri possono usare, ma non hanno bisogno, ossigeno; altri tipi non possono sopravvivere in presenza di ossigeno libero del tutto.