L'eubatterio è un regno enorme e diversificato di microbi procarioti che include clamidia, E. coli e cianobatteri. Gli organismi eubatterici sono usati per produrre formaggio e vino. Possono causare gravi infezioni nell'uomo e talvolta, come nel caso della flora intestinale umana, cambiano rapidamente da utili a dannose.
Gli eubatteri sono tutti procarioti. Ciò significa che i membri di questo regno, che è grande e diversificato come i regni delle piante e degli animali, non hanno un nucleo cellulare e generano energia senza le relazioni simbiotiche che definiscono gli eucarioti.
I cianobatteri, un tipo di eubatteri, sono tra le prime forme di vita ad apparire nei reperti fossili. Stromatophores coloniali stavano costruendo grandi tumuli, chiamati stromatoliti, sulla Terra 3 1/2 miliardi di anni fa. Queste alghe blu-verdi, come vengono spesso chiamate, furono i primi importanti produttori di ossigeno sulla Terra, e rimangono centrali per il mantenimento dell'equilibrio dell'atmosfera terrestre. Alcuni cianobatteri fissano l'azoto direttamente dall'aria, arricchendo il terreno e permettendo alle piante di prosperare.
I eubatteri nocivi esistono come parassiti. La clamidia e gli spirocheti responsabili della sifilide sono due esempi di eubatteri distruttivi. E. coli è probabilmente un altro bacillo dannoso. Questa specie risiede normalmente nell'intestino, dove aiuta la digestione, ma in alcuni casi può diventare pericolosa. E. coli resistente alla vancomyicina è un'infezione comune nei reparti ospedalieri.
