Alcuni esempi di proteine semplici sono istoni, globuline, gluteline, albuminoidi e albumine. Quando queste proteine vengono scomposte chimicamente con l'acqua attraverso il processo di idrolisi, di solito si suddividono in soli amminoacidi. Occasionalmente, si trovano anche contenere piccoli composti di carboidrati.
Gli istoni sono le proteine che aiutano il DNA a condensarsi in modo che possa adattarsi all'interno del nucleo sotto forma di cromosomi. Alcuni istoni fungono da strutture a forma di rocchetto che il DNA avvolge. Queste proteine hanno una carica positiva, che consente loro di essere attratti dal DNA caricato negativamente.
Le globuline sono semplici proteine costituite da anticorpi chiamati gamma globuline, enzimi e proteine di trasporto. Bassi livelli di globulina negli esami del sangue sono associati a condizioni come la nefrosi, la disfunzione epatica e l'anemia emolitica acuta. Al contrario, livelli elevati di globulina possono segnalare una vasta gamma di condizioni, alcune delle quali includono infezioni parassitarie, artrite reumatoide, disfunzione renale, leucemia e alcune infezioni batteriche e virali.
A differenza delle proteine semplici, le proteine coniugate contengono sia aminoacidi che componenti non proteiche. Nucleoproteine, fosfoproteine, lecitoproteine e glicoproteine sono alcuni esempi di proteine coniugate. Nel frattempo, una proteina derivata si forma attraverso l'alterazione fisica o chimica di una proteina semplice o coniugata. I peptidi e le proteine denaturate rientrano in questa categoria di proteine derivate.
