Il cloro può uccidere i microrganismi benefici nel suolo, influenzando così la crescita delle piante; tuttavia, la maggior parte dell'acqua potabile clorata non è abbastanza concentrata per influenzare negativamente la vita delle piante in una determinata area. Ciò è dovuto al fatto che il tasso di riproduzione dei microrganismi nel suolo è così elevato che tendono a riprodursi di nuovo prima la pianta può essere influenzata negativamente dal suolo.
La maggior parte delle comunità aggiunge piccole quantità di cloro all'acqua potabile per garantire la sicurezza dei residenti. L'acqua potabile tipica non contiene quantità sufficienti di cloro per eliminare veramente i microrganismi benefici nel terreno, con una minima influenza sulla crescita delle piante. I microrganismi benefici presenti nel suolo si riproducono a tassi così elevati, rendendo quasi mite gli effetti dell'acqua clorata.
Il cloro si lega anche alle superfici delle particelle del suolo, il che riduce la capacità del cloro di distruggere i microrganismi benefici. Inoltre, poiché l'acqua clorata gocciola verso i livelli inferiori del suolo, il cloro si lega alle superfici di quelle particelle di suolo, il che significa che l'acqua contiene meno cloro mentre scende. Gli studi dimostrano che il terreno sottoposto ad acqua potabile clorata mostrava solo una riduzione dei microrganismi nell'alto 1/2 pollice del suolo. I microrganismi nei livelli del suolo più profondi di 1 pollice non sono stati influenzati dal cloro.
