I fattori biotici di uno stagno includono tutti gli organismi viventi che costituiscono l'ecosistema stagno. I fattori biotici possono essere suddivisi in diversi livelli trofici, come autotrofi, eterotrofi e saprotrofi, a seconda della loro funzione nell'ecosistema.
Gli autotrofi, noti anche come produttori, includono piante come le alghe che possono convertire energia in cibo. La forma più comune di energia utilizzata è la luce solare, che viene poi convertita al cibo attraverso un processo chiamato fotosintesi. A seconda della posizione dello stagno, organismi come i batteri potrebbero anche utilizzare il calore prodotto dalle prese d'aria idrotermiche per produrre cibo.
Gli eterotrofi sono organismi che non possono produrre il proprio cibo e possono essere ulteriormente suddivisi in due tipi, consumatori primari e consumatori secondari. I consumatori primari includono organismi come insetti e crostacei, che consumano piante. I consumatori secondari sono in genere carnivori e comprendono diversi tipi di pesce, che si nutrono di eterotrofi, piante o entrambi.
Gli organismi saprotrofici, più comunemente noti come decompositori, sono responsabili della decomposizione della sostanza organica in nutrienti utilizzabili per gli autotrofi. Di solito includono certi tipi di funghi e batteri e abbattono la materia organica morta in anidride carbonica, azoto e fosforo. I decompositori si trovano nella parte inferiore degli stagni, dove è possibile trovare la maggior parte dei rifiuti organici.