I fattori biotici dei fiumi includono insetti, pesci, periphyton e macroinvertebrati bentonici suddivisi in gruppi di alimentazione funzionale come trituratori e pascolatori. Questi organismi viventi rappresentano alcuni dei più importanti fattori biotici in qualsiasi ecosistema fluviale , secondo Nature Education.
L'ecosistema fluviale fornisce un ambiente dinamico per la diversità biotica. Gli ecologi acquatici tendono a concentrarsi sui macroinvertebrati bentonici nei loro studi sugli ecosistemi fluviali a causa della loro abbondanza e complessità. I quattro gruppi di alimentazione funzionale di macroinvertebrati bentonici includono trituratori, che ciascuno lascia; collezionisti, che consumano materia organica finemente particolata; pascolatori, che si nutrono di periphyton; e predatori. L'habitat fisico del fiume stesso determina quale di queste quattro categorie di organismi è più pronunciata. Piccole correnti temperate, ad esempio, forniscono le condizioni ideali per lo sviluppo di trituratori e collezionisti, mentre i baldacchini che si aprono in grandi correnti forniscono ai pascoli un migliore accesso alla loro principale fonte di cibo, il periphyton.
I pesci sono anche un importante contributo all'ecosistema fluviale, in particolare i pesci anadromi che trascorrono la maggior parte della loro vita in un ambiente marino e viaggiano a monte per riprodursi. Questi pesci apportano all'ambiente sostanze nutritive marine, che almeno un esperimento è collegato a una maggiore abbondanza di insetti nell'ecosistema fluviale, come affermato da Nature Education.
