Tra i numerosi predatori dei cani della prateria dalla coda nera ci sono coyote, linci, tassi, volpi rapaci, aquile reali, falchi dalla coda rossa, falchi ferruginosi e serpenti a sonagli. Rari furetti dai piedi neri, gufi scavatori e alcune specie di serpenti scendono nelle bugie dei cani della prateria dalla coda nera per cacciarli.
A causa dell'abbondanza di predatori, i cani della prateria hanno posti di ascolto vicino alle uscite delle loro elaborate tribune sotterranee. Hanno una chiamata speciale tipo chirp che segnala che il pericolo è vicino. Un cane della prateria fa l'avvertimento iniziale e altri lo riprendono. Quando il pericolo è passato ed è sicuro uscire, un individuo suona il tutto chiaro, altri lo fanno eco, e presto l'intera città sta ballando e ballando.
I cani della prateria dalla coda nera vivono in comunità chiamate città che in genere coprono un miglio quadrato e contengono poche centinaia di individui. Tuttavia, la città più grande conosciuta si estendeva su 25.000 miglia quadrate e aveva una popolazione stimata di 400 milioni. In alcune aree, i cani della prateria sono considerati una specie chiave, contribuendo in modo vitale al benessere della flora e della fauna locali. Nei ranch, tuttavia, sono considerati parassiti e vengono sterminati. Oltre ai predatori e agli esseri umani, un altro pericolo per i cani della prateria è la malattia, che a volte reclama intere colonie. Anche se ci sono periodici tentativi di elencare il cane della prateria dalla coda nera come una specie minacciata o in via di estinzione, anche se nel 2009, il servizio americano di pesce e fauna selvatica ha stabilito che la protezione non era giustificata.
