I semi, se paragonati alle spore, hanno vantaggi distinti a causa dei loro gusci esterni e strutture interne chiamate endospermi, che forniscono nutrienti essenziali per le piantine chiuse. I semi si trovano solo nelle piante da fiore e nelle gimnosperme. Contengono embrioni profondi all'interno dei loro centri, che sono circondati da un sacco di sostanze nutritive e minerali racchiusi da un duro guscio protettivo esterno che protegge il seme in crescita dalla predazione e un'esposizione pericolosa per la vita agli elementi.
I duri gusci esterni di semi sono forse i loro beni più preziosi. I cappotti di semi aiutano a proteggere le piantine in crescita dai danni causati dalle attrezzature e dai macchinari agricoli, dall'essiccazione e dalla predazione da insetti, insetti e uccelli. I gusci proteggono anche da condizioni potenzialmente pericolose come vento, pioggia intensa, gelo e calore estremo. Questi gusci duri sono anche molto utili per proteggere le specie situate in aree a rischio di incendio: a differenza delle spore, che avvizziscono e muoiono a temperature elevate, i semi proteggono gli embrioni interni dalla distruzione durante gli incendi, consentendo loro di restare in silenzio e continuare a crescere. L'endosperma nei semi è anche un importante contributo alla crescita e al successo dell'embrione chiuso. Gli endospermi, molto simili agli uteri umani, forniscono piantine con i nutrienti e i minerali di cui hanno bisogno per crescere e svilupparsi pienamente.