Le applicazioni pratiche di elettroforesi su gel includono la tipizzazione di batteri, il monitoraggio delle fonti e la diffusione della malattia, il monitoraggio dell'evoluzione batterica per la progettazione del vaccino e la conferma di un'identità nei casi forensi. L'elettroforesi su gel abbraccia una vasta gamma di industrie come farmacologia, ricerca sul cancro, estrazione e produzione di birra.
L'elettroforesi su gel comporta il passaggio di una carica elettrica attraverso un materiale poroso dopo l'applicazione di una soluzione contenente la sostanza mirata. DNA, RNA e proteine richiedono metodi di estrazione, gel make-up e buffering diversi. L'elettroforesi sfrutta il fatto che i filamenti più corti viaggiano attraverso un mezzo gel a velocità più elevate, separando diverse molecole. La colorazione seleziona i singoli filamenti per l'identificazione. Edward M. Southern ha sviluppato una tecnica per trasferire i risultati dell'elettroforesi su gel a una membrana, preservando le posizioni relative delle molecole per ulteriori ricerche. Southern Blotting per DNA Northern Blotting ispirato per RNA e Western Blotting per proteine. Un'ulteriore rifinitura utilizza membrane in Nylon caricate per garantire risultati durevoli e riutilizzabili. Altri tipi di elettroforesi del gel di sopporto dell'identificazione molecolare quando le condizioni richiedono approcci diversi. L'elettroforesi capillare aumenta la sensibilità a particelle più piccole a scapito di letture meno coerenti. L'analisi dell'acido nucleico del peptide (PNA) combina una sonda di superficie e una sonda reporter che consente di identificare rapidamente DNA antrace e identificazione dell'RNA sul campo.
