Il Nicaragua è il più grande paese di tutto il Centro America, con una superficie totale di 81.008,2 miglia quadrate. Circa 74.558 miglia quadrate del paese è terra. Il Nicaragua condivide un lungo confine con l'Honduras a nord e un confine più breve con la Costa Rica a sud. Ha una costa che si estende per circa 565 miglia lungo l'Oceano Pacifico settentrionale a ovest e il Mar dei Caraibi a est.
I due più grandi laghi d'acqua dolce dell'America centrale, Lago de Managua e Lado de Nicaragua, si trovano entrambi in Nicaragua. Il Rio San Juan trasporta l'acqua dal Lago de Nicaragua verso est attraverso il paese, depositando le sue acque nel Mar dei Caraibi. Le pianure attraversano il bacino del Rio San Juan, ospitando sia foreste pluviali tropicali che savane. L'istmo nicaraguense si riferisce alla terra situata tra il Lago de Nicaragua e il Mar dei Caraibi. Il Río Tipitapa porta l'acqua dal Lago di Managua verso sud nel Lago de Nicaragua. Le altitudini più elevate del paese si trovano in un'area chiamata altopiano centrale, che si trova nel nord-est del paese. La parte occidentale del paese si trova lungo una faglia di due placche tettoniche.