Le principali suddivisioni del cervello sono il prosencefalo, il mesencefalo e il rhomencephalon. Questi sono anche indicati come proencefalo, mesencefalo e cervello posteriore. Queste tre divisioni sono ulteriormente suddivise in ventricoli, suddivisioni di ventricoli e strutture principali successive.
Il prosencefalo è costituito dal ventricolo laterale e dal terzo ventricolo. Questi due ventricoli sono ulteriormente suddivisi nel telencefalo e nel diencefalo. Da queste due suddivisioni sono definite le seguenti strutture principali: corteccia cerebrale, gangli basali, sistema limbico, talamo e ipotalamo.
Il mesencefalo è costituito dall'acquedotto cerebrale costituito da una suddivisione nota come mesencefalo. Questa suddivisione contiene due strutture principali chiamate tectum e tegmentum.
La terza suddivisione principale del cervello, il Rhombencephalon, contiene un ventricolo chiamato semplicemente quarto ventricolo. Questo ventricolo è costituito dal metencefalo e dal midollo. Queste due suddivisioni contengono tre strutture principali: il cervelletto, il ponte e il midollo allungato.
Queste tre principali suddivisioni del cervello si formano in diversi periodi attraverso lo sviluppo dell'embrione. Le parti del cervello che controllano aspetti più primitivi di tutti i mammiferi nel regno animale sono formate per prime. Seguendo questo sviluppo, cominciano a formulare aspetti più raffinati del cervello umano. È con l'aiuto di queste caratteristiche anatomiche altamente raffinate che il cervello umano si differenzia dalle altre specie.