Secondo il database dei rettili, la maggior parte dei serpenti ha 36 paia di cromosomi. Venti cromosomi sono considerati microcromosomi, mentre il resto è chiamato macrochromosomes. Tuttavia, il termine "serpenti" si riferisce a oltre 3.400 specie diverse e molti non hanno avuto il loro cariotipo studiato, quindi potrebbe esserci qualche variazione.
A differenza di molti rettili, come i coccodrilli, le tartarughe e alcuni gechi, il genere dei serpenti è determinato dai loro cromosomi, piuttosto che dalle condizioni ambientali che circondano le uova in via di sviluppo. Tuttavia, i serpenti mostrano lo schema inverso rispetto a quello dimostrato dagli umani. Mentre i maschi umani sono il sesso eterogametico, caratterizzati da un cromosoma X e Y, i serpenti femminili sono il sesso eterogametico e presentano un cromosoma Z e W.
