Non puoi vedere un microrganismo senza usare il microscopio. Inoltre non puoi assaggiare od annusare i microorganismi come i batteri nei cibi contaminati. Tuttavia, si sente l'odore dei batteri che metabolizzano il sudore. Le infezioni fungine delle unghie dei piedi producono anche un odore.
Mentre tutti i batteri e gli archei sono microrganismi, ci sono solo alcuni funghi e alghe. Alcuni animali, come i rotiferi e quasi tutti i protozoi, sono microscopici. Gli organismi minuscoli vivono nel terreno, nell'atmosfera, sul fondo dell'oceano e nelle profondità delle rocce. I microrganismi favoriscono la decomposizione nel riciclaggio dei nutrienti negli ecosistemi. I microrganismi aerodispersi possono influenzare le precipitazioni e le condizioni meteorologiche. Altri sono attivi nel ciclo dell'azoto.
