L'antagonismo microbico è il metodo per utilizzare colture consolidate di microrganismi per prevenire l'intrusione di ceppi estranei. Quando viene introdotto in un ambiente già colonizzato, un ceppo invasivo di batteri tende a non prosperare e può andare completamente estinto.
Un esempio di antagonismo microbico nel corpo umano è la resistenza dei batteri della bocca stabilizzati a nuovi ceppi che possono essere introdotti attraverso il contatto bocca-a-bocca. Ad esempio, dopo un bacio, vengono introdotti nuovi batteri nell'ambiente ostile di una bocca estranea. Una volta lì, la crescita dei batteri invasivi è inibita da composti antimicrobici secreti dalla flora nativa, nonché dalla stretta concorrenza per le risorse.
