Sia i funghi che le piante contengono cellule con nuclei e organelli legati alla membrana, che li differenzia dai batteri. Entrambi hanno celle circondate da pareti cellulari, che le differenzia dagli animali. Sono entrambi organismi stazionari che non si muovono.
Anche i funghi e alcune specie primitive di piante hanno somiglianze riproduttive. Tutti i funghi utilizzano le spore per riprodursi, mentre le specie vegetali più avanzate usano polline e semi per riprodursi. Alghe e felci sono le specie vegetali più comuni a rilasciare spore.
I funghi e le piante sono stati classificati come regni separati solo dal 1969, e entrambi i regni sono studiati come parte della botanica. Nonostante questa stretta classificazione, i funghi sono più strettamente legati agli animali che alle piante. Mentre piante e funghi condividono somiglianze strutturali, i funghi e gli animali discendono da un antenato più vicino di quanto non condivida con le piante.
La differenza principale tra piante e funghi è come ottengono l'energia. Le piante sono autotrofi o organismi che non consumano piante o altri animali per il sostentamento; usano la fotosintesi per trasformare la luce solare in energia chimica. I funghi sono eterotrofi o organismi che ottengono energia da altri organismi. I funghi rilasciano enzimi digestivi che riducono il loro cibo in nutrienti che possono essere assorbiti; usano questi enzimi per consumare piante, animali e altri funghi.