La diarrea acquosa cronica è spesso causata da virus, batteri o parassiti provenienti da acqua contaminata o da alimenti e farmaci, come antibiotici che disturbano l'equilibrio batterico dell'intestino, spiega la Mayo Clinic. Persone che sono lattosio intollerante ed esposto ai latticini può manifestare diarrea cronica.
La diarrea cronica e acquosa è anche causata da allergie a determinati alimenti, malattie intestinali, lassativi, abuso di alcool e diabete, secondo WebMD. Le persone con una tiroide iperattiva possono sperimentare diarrea cronica oltre a pazienti sottoposti a radioterapia, interventi chirurgici sull'apparato digerente e chi soffre di cancro. Esercizio vigoroso come la corsa può produrre diarrea cronica e acquosa.