Gli ecosistemi marini e d'acqua dolce interagiscono negli ecosistemi costieri dove i due ambienti si mescolano tra paludi di mangrovie, estuari e baie tra altri ambienti. La mescolanza di acqua dolce e salata dà origine a sfere ecologiche e biodiversità uniche che non possono sopravvivere in tutte le condizioni tranne quelle fornite dagli ecosistemi costieri.
Le paludi di mangrovie si verificano quando miscela di acqua salata e acqua dolce, consentendo la crescita di imponenti mangrovie che formano corsi d'acqua e pozze a causa della crescita dei loro sistemi di radici. Questi ambienti unici come paludi ospitano crostacei, pesci e molti altri tipi di animali che prosperano nell'interstizio tra ecosistemi.
Alcuni animali possono muoversi liberamente tra acqua dolce e acqua salata. Questi animali includono il coccodrillo di acqua salata e diverse specie di pesci. Adattati in tal modo, possono entrare e uscire dagli ecosistemi costieri senza doversi preoccupare dei danni ai loro organi a causa dell'impossibilità di elaborare uno degli ambienti dati.
Gli ecosistemi costieri sono molto sensibili alle attività umane e, a causa della loro scala limitata e degli alti tassi di diversità specializzata, possono essere danneggiati gravemente dall'inquinamento e dalla navigazione. Molti ecosistemi costieri sono a rischio a causa delle spedizioni e di altre attività umane all'interno o intorno ai loro confini, rendendo questi ecosistemi tra i più fragili del mondo.