Il perossido di idrogeno si decompone naturalmente in acqua e ossigeno quando esposto alla luce solare, ma può anche essere reso inerte aggiungendo acido ossalico, carbone attivo o molti altri acidi dolci. Il perossido di idrogeno è più basilare di acido, quindi se è necessario neutralizzarlo più velocemente di quanto si neutralizzerebbe automaticamente alla luce del sole, è necessario aggiungere un tipo di acido per portare il suo valore di pH più vicino a 7.
La soluzione standard di perossido di idrogeno che può essere acquistata presso il negozio è in realtà solo circa il 3% di perossido di idrogeno e il resto è acqua. Questa soluzione è una base molto mite che non causerà alcun danno. Viene venduto in una bottiglia opaca perché si decompone molto rapidamente se esposto alla luce solare. Se questa soluzione deve essere smaltita, può semplicemente essere versata nello scarico a causa di quanto sia mite la base.
Alcune soluzioni di perossido di idrogeno possono contenere fino al 30 percento di perossido di idrogeno. Queste soluzioni devono essere maneggiate con cura e devono essere smaltite correttamente, e sicuramente non devono essere semplicemente gettate nel lavandino. La soluzione può essere diluita con acqua e lasciata a decomporsi naturalmente, oppure può essere neutralizzata aggiungendo alcuni acidi come l'acido ossalico o il carbone attivo. Va notato che la neutralizzazione con un acido produrrà una reazione esotermica, il che significa che produrrà calore.