I semi di mela sono dispersi in natura attraverso la zoocoria, o quando sono trasportati da animali. Gli animali mangiano il frutto e portano via i semi nei loro tratti digestivi. Quando il seme passa nelle feci degli animali, il seme germoglia e propaga un nuovo albero di mele.
I meli coltivati vengono propagati asessualmente tramite l'innesto. Gli agricoltori fanno questo per mantenere le varietà di mele coerenti all'interno di un frutteto. Poiché ogni seme di mela contiene una combinazione unica di DNA, non esistono due semi dello stesso albero o addirittura all'interno della stessa mela che producono alberi identici. Diverse dimensioni del portinnesto utilizzato in un innesto producono diverse dimensioni di meli, che producono tutti frutti a velocità diverse.