La cromatografia viene utilizzata per studiare il pigmento delle piante estraendo i pigmenti dalla pianta e quindi ordinandoli per le loro caratteristiche fisiche in modo che possano essere analizzati. La cromatografia è utile per separare diversi tipi di pigmenti vegetali perché sono molto simili tra loro e possono essere difficili da distinguere o fisicamente separati altrimenti.
La cromatografia è un metodo mediante il quale i singoli elementi di una singola sostanza o oggetto sono separati l'uno dall'altro per essere studiati individualmente. Questo compito è spesso complicato dal fatto che alcuni pezzi di una cellula, come il pigmento nelle cellule vegetali, possono essere difficili da differenziare chimicamente. Per separare gli elementi di una sostanza non gassosa, gli scienziati di solito passano la sostanza attraverso una miscela di soluzioni. Molti laboratori di biochimica oggi hanno una macchina, chiamata cromatografo, appositamente per questo scopo.
Quando una cellula vegetale viene fatta passare attraverso una soluzione, diversi pigmenti si legheranno a diverse parti della soluzione. Controllando le soluzioni utilizzate, gli scienziati possono separare i pigmenti l'uno dall'altro alla volta, formando diversi anelli di colore. Questi anelli rappresentano ciascuno un diverso tipo di pigmento nella cellula della pianta e ciascuno ha le proprie caratteristiche fisiche. Anche se sono chimicamente simili, questo separa i pigmenti e consente ai biochimici di studiarli.