Un flagello è come una lunga coda che sporge dal corpo dei batteri che spinge i batteri in avanti. Può essere pensato come la coda di un girino che spinge il girino in avanti in acqua.
I batteri spesso vivono liquidi e hanno bisogno di un modo per muoversi nel loro ambiente. Un modo in cui i batteri si muovono nel liquido è attraverso l'uso di un flagello. La coda spinge i batteri in avanti in un movimento di nuoto come una pinna caudale, e può anche spingere fuori da altre cellule e afferrare le superfici per estrarre i batteri.