I krill vengono mangiati da balene, pinguini, foche, calamari, pesci e persone. Sebbene i krill siano mangiati anche da centinaia di altri animali, questi sono i loro più grandi predatori. Le balene mangiano la maggior quantità di krill; la balena blu può mangiare fino a quattro tonnellate di krill al giorno. La dieta dei pinguini Adelie consiste principalmente di krill, anche se tutte le 17 specie di pinguini dipendono dal krill per sopravvivere.
Le più piccole specie di foche dipendono dal krill per sopravvivere, mentre foche più grandi, come il leopardo, mangiano principalmente altri animali, come i pinguini e le foche più giovani. La maggior parte del krill viene catturata nell'Artico, ma il loro numero è diminuito di almeno l'80 percento dagli anni '70. Per questo motivo, la pesca al krill è ora monitorata per proteggere la popolazione in declino.
Il declino del krill è causato da disturbi nel loro ecosistema, come il riscaldamento globale e il cambiamento climatico. L'aumento delle temperature artiche a causa del riscaldamento globale ha causato la formazione di meno ghiaccio marino, con conseguente minor consumo di cibo per il krill perché mangiano le alghe che crescono sotto il ghiaccio marino. Un'altra causa del declino della popolazione dei krill è stata causata da una diminuzione della concentrazione di diatomea nel Mare di Bering avvenuta nel 1998 durante una fioritura di coccolithophore. I Coccolithophores sono anche parte della dieta del krill e il calo della concentrazione li ha fatti diventare più piccoli. Le uccisioni non sono in grado di nutrirsi del coccolithophore più piccolo, con conseguente minor disponibilità di cibo per il krill.