Gli enzimi accelerano le reazioni chimiche abbassando i tassi di attivazione. In generale, la minore quantità di energia di attivazione che ha una reazione potenziale, più veloce sarà la velocità di reazione. Gli enzimi cambiano forma durante il processo di reazione, che consente loro di ridurre efficacemente i tassi di attivazione.
Quando gli enzimi cambiano forma, il processo viene definito come adattamento indotto. Durante questo processo, gli enzimi subiscono essenzialmente trasformazioni fisiche per legarsi con altri enzimi nelle reazioni chimiche. Questi enzimi si combinano con enzimi simili per formare reazioni complete, proprio come il processo di completamento di un enigma. Gli enzimi contengono anche hotspot o siti attivi, che sono ubicazioni su superfici enzimatiche che consentono ai substrati di legarsi. Questi siti fungono anche da luoghi di accoglienza per le reazioni chimiche che si verificano: gli spot sono frastuoni di attività e agiscono in modo molto simile a stazioni ferroviarie o terminal degli autobus, consentendo di effettuare scambi vitali. Queste reazioni chimiche si verificano sulle superfici degli enzimi, che è il luogo in cui i substrati si legano. I siti attivi enzimatici sono stabilizzati da più reazioni più deboli (come i contatti idrofobici, i legami idrogeno e le interazioni elettrostatiche) che alla fine consentono loro di sostenere reazioni chimiche rapide. Le reazioni chimiche richiedono anche un cambiamento interno: ciò è reso possibile dalla formazione di substrati all'interno degli enzimi, che salgono in superficie e si legano a siti attivi.
