La maggior parte dei funghi non ha un effetto negativo sull'uomo, anche se alcune specie possono causare malattie. Un esempio di questo è la muffa indoor, che può causare ed esacerbare le condizioni respiratorie, secondo l'Università del Minnesota.
Sebbene la maggior parte dei funghi non causi danni agli esseri umani, quelli che lo fanno possono avere effetti gravi. Ad esempio, se i funghi opportunistici del suolo penetrano nella ferita di una persona il cui sistema immunitario è compromesso, come un paziente diabetico, può causare un'infezione aggressiva. La maggior parte delle infezioni fungine causali sono superficiali, il che significa che si verificano attraverso la pelle oi capelli. Esempi di questo includono il piede e la tigna dell'atleta.
Quando i funghi entrano nel corpo come un'infezione, possono causare reazioni sistemiche fatali. Le persone che vivono in famiglie in cui sono presenti muffe sono a rischio di sviluppare infezioni superficiali e interne. Il tipo di infezione che incontrano e quanto è grave dipende dal tipo di fungo e dalla sua tossicità. Ad esempio, le persone che inalano muffe verdi sono più a rischio di quelle che inalano altri tipi. I problemi di salute derivanti dall'inalazione di muffe comprendono reazioni allergiche, sinusite a seguito di esposizione ad allergeni, polmonite e asma allergico.
