Il sistema immunitario mantiene l'omeostasi impedendo ai patogeni di interrompere il normale funzionamento del corpo. Lo raggiunge in vari modi, inclusa l'immunità adattativa quando il corpo incontra un nuovo agente patogeno, l'immunità innata, secernendo acidi sul la pelle e l'utilizzo di membrane mucose per i batteri guasti.
Diversi fattori possono disturbare l'omeostasi, inclusi virus e altri microrganismi che inducono febbri, aumentare la pressione sanguigna e alterare il pH del sangue. Il sistema immunitario mantiene l'omeostasi impedendo a tali microrganismi di diventare problematici e riducendo la loro capacità di interrompere il normale funzionamento. Ad esempio, nell'immunità adattativa, il sistema immunitario ricorda un agente patogeno quando entra per la prima volta nel corpo. Quando entra nel corpo per la seconda volta, lo affronta immediatamente, impedendogli di causare una seconda infezione e disturbando l'omeostasi.
Ci sono molti modi in cui il sistema immunitario protegge il corpo, compresa la pelle, gli antigeni e le mucose. La pelle è la prima linea di difesa del corpo. Il sistema immunitario promuove un pH della pelle che scoraggia alcuni batteri. Quando gli antigeni incontrano una sostanza estranea, la ricordano e successivamente producono anticorpi quando entrano di nuovo nella circolazione sanguigna. Le vie respiratorie ospitano mucose e ciglia. Le mucose hanno enzimi che combattono gli agenti patogeni e le ciglia li spazzano via.