La Nigeria ottenne l'indipendenza l'1 ottobre 1960 attraverso le costituzioni che furono approvate dal governo britannico. La nuova Costituzione stabilì un sistema di governo federale con un Primo Ministro eletto e un capo di stato maggiore.
Con l'indipendenza che incombeva nel 1959, si tenne un'elezione per eleggere un leader; tuttavia, nessun partito ha vinto la maggioranza. La National Population Commission of Nigeria (NPC) unita al Consiglio nazionale della Nigeria e al Camerun (NCNC) per formare un governo adatto ai suoi cittadini. Hanno eletto Abubakar Tafawa Balewa dell'NPC come primo ministro e Azikiwe dell'NCNC come governatore generale. Quando la Nigeria fu trasformata in una repubblica nel 1963, Azikiwe fu nominato presidente.
I primi anni di indipendenza della Nigeria hanno visto grandi disordini e conflitti tra le regioni nigeriane. Nel 1962, la regione occidentale aveva una parte del Gruppo d'azione, un altro partito politico, scisso sotto S. I. Akintola per formare il Partito Democratico Nazionale nigeriano (NNDP). Nel 1963, la regione mediorientale di Edo fu formata da una parte della regione occidentale. Le elezioni del 1964 furono fortemente contestate e la coalizione NPC-NNDP (chiamata National Alliance) fu vittoriosa. I colpi guidati dagli ufficiali dell'esercito Hausa nel 1966 furono responsabili della morte di Ironsi. Più tardi quell'anno, molti Igbo che vivevano nel nord furono massacrati.