La clonazione crea polemiche per diversi motivi, ampiamente classificati come preoccupazione per la sicurezza umana e preoccupazione per il trattamento improprio o non etico degli animali. La clonazione attira la resistenza di alcuni per alterare i processi biologici per migliorare o creare alcune caratteristiche, come un colore più luminoso, una taglia più grande o una pelliccia più morbida. Alcuni sostengono che questi cambiamenti sono in conflitto con le norme biologiche e comportano rischi di malattia e malattia per gli esseri umani e altri animali esposti agli organismi geneticamente modificati.
La clonazione attira critiche nel contesto della replicazione di animali e piante, e invita ancora più critiche quando applicate all'uomo. Mentre alcuni ricercatori e scienziati lodano la clonazione per sradicare alcune malattie e facilitare l'immunizzazione, altri citano la resistenza alle malattie e lo sviluppo di nuove allergie come contrappunti. Alcuni ricercatori, ad esempio, credono che bere latte di animali clonati, fortificato con sostanze nutritive e antibiotici, possa controllare la diffusione della malattia in aree povere, dimostrando di essere più efficaci e meno costosi rispetto alle vaccinazioni tradizionali.
Altri, come i sostenitori del benessere degli animali, avvertono queste mosse come sperimentali e non basate su anni di studi scientifici, il che solleva questioni di sicurezza. La clonazione ha criticato alcuni biologi per la preoccupazione che la selezione e la sostituzione dei geni artificiali alla fine modifichi alcune specie, mettendole a rischio di mutazioni, difetti e persino estinzione, poiché la variazione genetica diminuisce nel tempo.