I nuclei delle cellule di elodea sono quasi invisibili, ma possono essere visualizzati tramite microscopia se la cellula è macchiata. Gli scienziati usano una varietà di macchie per evidenziare le cellule e le loro strutture, al fine di studiarle correttamente sotto ingrandimento.
Per vedere i nuclei di una cellula di elodea, l'osservatore dovrebbe prima macchiare la cellula a seconda che vorrebbero macchiarlo vivo o morto. Se l'osservatore desidera vedere il comportamento delle cellule, lo tratterà con una soluzione colorante che non danneggia la specie e la monterà su un vetrino da microscopio. Se desiderava osservare la cella in uno stato statico, eseguiva la fissazione, tramite calore o altro, per uccidere la cella. Quindi la cella verrebbe macchiata e montata su una diapositiva.