Esistono molte differenze significative tra la replicazione del DNA procariotico ed eucariotico. Una di queste differenze è la complessità del processo di replicazione delle cellule eucariotiche rispetto alla relativa semplicità del processo di replicazione nelle cellule procariotiche. Un'altra enorme differenza è la velocità con cui avviene la replica.
Poiché le cellule procariotiche hanno una struttura più semplice delle cellule eucariotiche, il processo di replicazione del DNA per le cellule procariotiche è molto più semplice. Per uno, le cellule procariotiche non hanno nuclei in cui si trova il materiale genetico. La replicazione avviene nel citoplasma delle cellule procariotiche in contrapposizione alla replicazione che si verifica nel nucleo delle cellule eucariotiche.
L'origine della replicazione nelle cellule procariotiche è limitata a un posto, mentre ci sono oltre 1.000 origini nelle cellule eucariotiche. Nelle cellule procariotiche, la replicazione avviene un punto alla volta, mentre la replicazione eucariotica avviene simultaneamente in tutti questi punti di origine. Accanto a questo, le cellule procariotiche hanno una sola forcella di replicazione mentre le cellule eucariotiche hanno molte forcelle di replicazione. I cromosomi delle cellule procariotiche non hanno cromatina, che costituisce la maggior parte dei cromosomi nelle cellule eucariotiche.
Infine, la replicazione procariotica è veloce mentre la replicazione eucariotica è lenta. Questa velocità con cui le cellule procariote si replicano è vista con la rapida crescita dei batteri.
