La posizione di Thomas Jefferson sulla tariffa protettiva era negativa, sebbene accettasse che fosse necessario. Jefferson un tempo credeva nel libero scambio, ma arrivò a capire che non avrebbe mai funzionato se tutte le nazioni non avessero accettato, afferma la storia degli Stati Uniti.
Jefferson credeva che un forte governo centrale avrebbe inevitabilmente minacciato le libertà individuali. Ha favorito una società agraria più semplice. Sebbene le tariffe incoraggerebbero la crescita della cultura della città che Thomas disprezzava, si rese conto che erano un male necessario. Jefferson si rese anche conto che le tariffe e le tasse erano gli unici modi per aggiustare il debito della nazione. Sebbene Jefferson abbia preferito la tariffa, ha fatto ben poco per sostenerlo, e il suo partito repubblicano-democratico ha mostrato scarso interesse in esso, afferma The North Carolina History Project. Jefferson prevedeva le conseguenze della tariffa, che sosteneva l'economia manifatturiera e industriale, ma la sua opinione era che un'economia forte e una nazione autosufficiente fossero più importanti del suo sogno di una società agricola. Sebbene alcuni sostenitori di Jefferson si sentissero traditi dalla sua posizione sulla tariffa, c'era sicuramente un ragionamento logico e forte dietro la sua decisione. Jefferson ha anche optato per la tariffa come mezzo per evitare la tassazione diretta dei cittadini, afferma The Freeman.