Alcune specie di funghi producono tossine dannose che causano malattie o morte se mangiate. I funghi sono anche responsabili di infezioni della pelle come tigna e piede d'atleta. Altri funghi hanno spore disperse nell'aria che causano malattie e infezioni potenzialmente letali, secondo il Fungal Infection Trust.
Le forme di funghi unicellulari, chiamati lievito, hanno la capacità di diventare patogeni. La Candida albicans, un lievito normalmente presente nella bocca, nell'esofago, nell'intestino e nella vagina, causa tosse orale e infezione da lievito vaginale o intestinale se si espande eccessivamente. Un altro lievito chiamato Cryptococcus neoformans causa una pericolosa e potenzialmente letale infezione della membrana cerebrale chiamata meningite criptococcica.
Le muffe, che sono funghi pluricellulari, causano il decadimento di alimenti e verdure e secernono micotossine che causano aborto, difetti alla nascita e cancro al fegato, come affermato da Health Hype. A partire dal 2012, le malattie fungine e le infezioni distruggono circa 125 tonnellate delle prime cinque colture alimentari ogni anno, che sono riso, grano, mais, patate e soia. Il danno a queste colture costa all'agricoltura globale circa 60 miliardi di dollari all'anno. Le colture danneggiate colpiscono in modo sproporzionato le nazioni in via di sviluppo che fanno molto affidamento su queste colture. Nuove malattie fungine minacciano l'esistenza di anfibi in via d'estinzione, a rischio di estinzione, tartarughe marine, pipistrelli e coralli, riferisce Science Daily.
