I fattori abiotici di un estuario sono la profondità dell'acqua, la salinità, i nutrienti, la temperatura dell'aria e dell'acqua, il pH dell'acqua, l'ossigeno disciolto e la torbidità o torbidità. I nutrienti sono sostanze nell'acqua come azoto e fosforo, disponibile per gli organismi come cibo.
Un estuario è un ecosistema in cui la foce di un fiume o di un fiume incontra la marea del mare. Un fattore abiotico è una parte non vivente di un ecosistema. Per determinare la salute degli estuari, gli scienziati monitorano sia i fattori abiotici che gli esseri viventi o i fattori biotici.
Il pH misura acidità o alcalinità. Un valore di pH di 7 è neutro. Valori superiori a 7 sono alcalini e meno di 7 sono acidi. Se l'acqua è troppo acida o troppo alcalina, alcuni tipi di organismi non prosperano.
Gli estuari sono un posto primario nel ciclo dei nutrienti della natura che rende molti elementi disponibili agli organismi come cibo. In un estuario salutare, gli elementi rimangono in equilibrio. Troppo azoto, ad esempio, e il numero di alghe possono esplodere, usare nutrienti in eccesso, quindi morire e consumare troppa ossigeno mentre si decompongono. Quando le alghe consumano troppo cibo e ossigeno, possono negarle ad altri organismi. Inoltre, le fioriture di alghe fanno salire il pH. Se la fioritura è grave, l'aumento del pH può uccidere gli animali acquatici.
La torbidità è una misura della materia sospesa nell'acqua. Se l'acqua è troppo torbida, poca o nessuna luce solare può penetrare per nutrire le piante acquatiche, quali altri organismi si nutrono e che svolgono il compito necessario di
ossigenare l'acqua.