I licheni possono appartenere a uno, due o tutti e tre i seguenti regni: Funghi, Protista e Monera. I licheni sono gruppi di più organismi, che possono presentarsi sotto forma di funghi, protisti e Monere. Sebbene condividano la classificazione dei licheni, le specie variano ampiamente in habitat, aspetto e caratteristiche fisiche e biologiche a seconda del regno a cui appartengono.
Licheni appartenenti al regno I funghi hanno la capacità di riprodursi in modo asessuato e producono il loro cibo attraverso il processo della fotosintesi. I licheni fungini possono apparire come funghi e altri funghi all'esterno, ma contengono caratteristiche del lichene all'interno. Alcuni licheni prendono la forma di cellule di alghe; questi organismi appartengono al regno Protista mentre altri licheni sono composti da cianobatteri e, come tali, cadono nel regno Monera. I licheni di Monera appaiono come alghe blu-verdi e vivono principalmente in ambienti acquatici, mentre i protisti possono vivere sulla terra o nell'acqua, e i licheni fungini crescono tipicamente sulla terra. Il lichene può crescere in molti habitat e tollerare condizioni estreme, come i climi desertici e la tundra artica, molto bene. I licheni crescono nel terreno e su piante e alberi in decomposizione, oltre a rocce, foglie di alberi, cortecce di alberi e persino altri licheni. Si riproducono sessualmente e asessualmente e generano pori e semi.