Un elenco di batteri non patogeni è una descrizione dei tipi di batteri che non causano malattie negli esseri umani. Essi comprendono stafilococco, lactobacillus, Escherichia coli, bifidobatteri, batteroidi e lino Brevibacterium. Questi batteri hanno ruoli positivi nel funzionamento del corpo e sono quindi innocui.
Secondo SFGate, le specie di lattobacilli si trovano negli alimenti fermentati e in altri prodotti alimentari comuni, come il latte. Sono anche parti importanti della microflora vaginale umana, intestinale e orale. I lattobacilli più comuni comprendono L. plantarum, L. reuteri e L. acidophilus. Il Lactobacillus è in grado di produrre acido lattico e utilizzare il lattosio. Ciò lo rende importante nei processi di fermentazione degli alimenti, come la produzione di yogurt. Escherichia coli fa parte della normale flora all'interno dell'intestino tenue e piccolo. Aiuta la digestione abbattendo gli zuccheri non digeriti. Produce anche biotina e vitamina K, che vengono utilizzati nei processi cellulari. Il batterioide si trova all'interno dell'intestino. Impedisce ai batteri patogeni di colonizzare l'intestino, abbatte i nutrienti utili e consuma nutrienti non importanti. Lo Stafilococco non patogeno, come l'epidermide di Staphylococcus, fa parte della normale flora della pelle, delle ghiandole sudoripare e del condotto uditivo. I bifidobatteri fanno parte della normale flora del colon. Viene utilizzato nei processi dell'industria alimentare per produrre prodotti probiotici. Alcune specie di batteri non patogeni vengono applicate nei processi terapeutici, come il trattamento delle allergie.